Квест «Сталкер-66» был разделен на практический и теоретический туры. В практическом туре участникам предстояло пройти конкурсные этапы, связанные с географией, краеведением, историей, ботаникой, зоологией, астрономией, литературой, а также показать спортивные и туристские навыки в постановке палатки, разведении костра, прохождении навесной переправы, завязывании узлов. Этапы были подобраны таким образом, что любая команда-участник квеста по своему усмотрению и по своим знаниям и навыкам могла выбрать этапы для прохождения. Время прохождения практического тура — 2 часа, но по многочисленным просьбам участников время прохождения этапов было увеличено до 2,5 часа. Этапы, представленные в практической части квеста: Дендрология, Орнитология, Энтомология, Геология, Кинология, Разведение костра, Переправа, Топонимика, Гербы, История (пещера первобытного человека), Литературные путешествия, Астрономия, Медицина, Лекарственные растения, Постановка палатки, Карта минералов, Заповедник, Узлы, Ориентирование.
