Новый царь Василий Шуйский при воцарении торжественно поклялся никому не мстить за прошлое. Сам Шуйский шагнул на царский трон почти что из могилы: при Лжедимитрии он был осужден на смерть, но, как утверждают некоторые, помилован по просьбе Власьева. Была такая просьба Власьева или нет — мы точно не знаем. Но столь влиятельный приверженец Лжедимитрия царю Василию был явно опасен. И поэтому в 1606 году Власьев посылается в Уфу, формально — на воеводство, а фактически — в ссылку (у него отобрали поместья и лишили его чинов).
В немногих дошедших до нас от тех времен документах есть сведения о пребывании Власьева в Уфе. По распоряжениям Власьева служилым людям отводилась земля. Об этом говорится в «Отводной книге по Уфе. 1591 —1629». Из той же «Отводной книги» видно, что когда в Уфе А. Власьев был вторым воеводой, главным же воеводой (первым) являлся Никита Васильевич Годунов. Как сработались эти два бывших сановника, в прошлом смертные политические враги,— неизвестно.
Василий Шуйский царствовал, как известно, недолго — 4 года.